第三代DNA測序技術改變了基因組學的研究方法,并帶動了大規(guī)模群體基因組組裝的研究?;蚪M組裝是基因組學研究的第一個步驟,也是新技術新方法的試金石。原有的長序列組裝程序需要數(shù)以千計的中央處理器數(shù)小時才能組裝成一個人類基因組,并且在通量和成本方面滯后于測序技術。研究團隊開發(fā)的一個長片段組裝程序wtdbg2(https://github.com/ruanjue/wtdbg2),其速度是已發(fā)布工具的2-17倍,同時實現(xiàn)了相當?shù)倪B續(xù)性和精確性,為未來群體規(guī)模的長片段組裝奠定了基礎。
wtdbg2算法的概要