肺魚是四足動物現(xiàn)存最近的親戚,保存了與水陸過渡有關(guān)的祖先特征。但它巨大的基因組阻礙了我們對這一關(guān)鍵轉(zhuǎn)變的深入理解。本研究使用自主開發(fā)的三代測序組裝算法用很短時間就完成了1.5TB的三代校正數(shù)據(jù)分析,得到迄今為止數(shù)據(jù)量最大,高達(dá)39.1Gb的基因組序列,完整度高達(dá)95%,高質(zhì)量解析了迄今組裝難度最大的非洲肺魚基因組。超長長度的基因與其他基因的表達(dá)水平相似,表明肺魚已經(jīng)進(jìn)化出了較高的轉(zhuǎn)錄效率來保持基因表達(dá)的平衡。該基因組是目前已知最大的脊椎動物基因組,這一成果標(biāo)志著我國在超大基因組解析方面已經(jīng)達(dá)到國際頂尖水平。
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[2021]非洲肺魚基因組揭示脊椎動物水陸過渡(African lungfish genome sheds light on the vertebrate water-to-land transition)(基因組所,阮玨,共同第一作者-六)
發(fā)布時間:2023-09-01
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