近期,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在小菜蛾蛋白質(zhì)基因組方面研究取得重要突破,為闡明小菜蛾對Bt殺蟲劑抗性調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了重要的遺傳信息。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在蛋白組學(xué)權(quán)威期刊《分子與細(xì)胞蛋白組學(xué)(Molecular & Cellular Proteomics)》上。
隨著高通量測序技術(shù)的不斷發(fā)展,上萬種生物的全基因組DNA序列被測序完成。其基因組的注釋主要基于預(yù)測軟件和已知蛋白的同源搜索,不可避免地導(dǎo)致編碼蛋白質(zhì)基因的錯(cuò)誤注釋和丟失、假基因廣泛存在。另外,由于缺少肽段等信息,大量基因被注釋為未知功能或假設(shè)的蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)基因組(Proteogenomics)是一種利用蛋白質(zhì)組學(xué)的相關(guān)數(shù)據(jù)對基因組進(jìn)行注釋校正的新方法,由于其結(jié)合了大量生物體蛋白質(zhì)氨基酸信息,從而有力地彌補(bǔ)基因組上基因?qū)ふ液妥⑨尩牟蛔?。小菜蛾是一種世界性重要農(nóng)業(yè)害蟲,每年因小菜蛾造成的損失高達(dá)40億–50億美元。小菜蛾幾乎對所有的殺蟲劑均產(chǎn)生了不同程度的抗藥性,包括微生物殺蟲劑Bt。該團(tuán)隊(duì)利用鳥槍法高效液相色譜-電噴霧-質(zhì)譜/質(zhì)譜(shotgun HPLC-ESI-MS/MS)對小菜蛾幼蟲中腸蛋白質(zhì)進(jìn)行測定,結(jié)合其基因組數(shù)據(jù),完成了首個(gè)小菜蛾中腸蛋白質(zhì)基因組分析。利用獲得的小菜蛾BBMV蛋白質(zhì)譜圖,鑒定到了大量與小菜蛾殺蟲劑抗性相關(guān)的蛋白質(zhì),同時(shí),還糾正了小菜蛾的基因注釋,鑒定了大量新基因以及新的基因剪切形式。
該項(xiàng)成果得到了國家自然科學(xué)基金和“863”計(jì)劃等資助。論文第一作者為蔬菜所博士后朱勛,通訊作者為張友軍研究員。(通訊員 李海芬)
相關(guān)鏈接:http://www.mcponline.org/content/early/2016/02/22/mcp.M115.050989.full.pdf+html?sid=4e5695cc-66b9-4845-bf51-aff931d6c5c3
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