近日,從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所獲悉,該所豬遺傳育種科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)通過對(duì)豬全基因拷貝數(shù)變異進(jìn)行掃描,獲得了多個(gè)與豬肉品質(zhì)性狀顯著相關(guān)的基因拷貝數(shù)變異。相關(guān)研究成果于2015年8月正式發(fā)表于國際學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)報(bào)告(Scientific Reports)上。
我國地方豬種以肉質(zhì)好而聞名于世,如何將我國地方豬種高肌內(nèi)脂肪含量(IMF)等遺傳優(yōu)勢盡快轉(zhuǎn)入到占絕大部分市場的瘦肉型豬中去又不使其它性狀受到過多影響,是目前研究者們面臨的一項(xiàng)重大課題。研究表明,作為基因組覆蓋范圍最廣的變異之一,拷貝數(shù)變異(CNVs)對(duì)多種性狀都發(fā)揮了重要功能,是解釋單核酸多態(tài)性(SNP)效應(yīng)之外“丟失的遺傳”的最可能變異之一。
該團(tuán)隊(duì)在對(duì)高肌內(nèi)脂肪含量、大理石紋、屠宰后6小時(shí)、24小時(shí)的pH值、水分及剪切力的關(guān)聯(lián)研究中共得到長度從208.53Kb到3.27Mb等長度不等的15個(gè)拷貝數(shù)變異。驗(yàn)證試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),15個(gè)拷貝數(shù)變異全部能被二代測序結(jié)果驗(yàn)證,73.3%(11/15)能被定量表達(dá)結(jié)果驗(yàn)證。關(guān)聯(lián)分析結(jié)果顯示,與肉質(zhì)性狀相關(guān)聯(lián)的拷貝數(shù)變異共有8個(gè)。在進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析的12個(gè)性狀中,有4個(gè)性狀與1個(gè)以上拷貝數(shù)變異有顯著關(guān)聯(lián)。綜合神經(jīng)生長因子1(Ntn1)基因內(nèi)的拷貝數(shù)變異劑量、基因表達(dá)等結(jié)果,推測Ntn1基因通過內(nèi)部拷貝數(shù)變異的劑量效應(yīng)對(duì)高肌內(nèi)脂肪含量產(chǎn)生一定影響,可作為肉質(zhì)性狀的候選標(biāo)記之一進(jìn)行育種。
據(jù)悉,在豬全基因組范圍內(nèi)進(jìn)行肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)的研究在國際上尚屬首次。
發(fā)表論文鏈接:http://www.nature.com/articles/srep12535
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