近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)和美國(guó)康奈爾大學(xué)BTI合作解析了世界重大農(nóng)業(yè)害蟲溫室白粉虱基因組,揭示了其發(fā)育特異性表達(dá)和抗藥性分子機(jī)制。溫室白粉虱基因組的解析對(duì)深入開展白粉虱功能基因組學(xué)研究、植物-昆蟲-微生物及病毒互作、粉虱類害蟲抗性治理應(yīng)用均具有重要意義。相關(guān)研究在線發(fā)表于《分子生態(tài)資源(Molecular Ecology Resource)》。
據(jù)謝文副研究員介紹,溫室白粉虱(Trialeurodes vaporariorum, n="11)和煙粉虱是世界上分布最廣且危害最為嚴(yán)重的2種粉虱類害蟲。煙粉虱基因組早在2016年和2017年由合作雙方共同解析完成,但溫室白粉虱基因組一直懸而未決。本研究中,利用三代測(cè)序平臺(tái)Pacbio長(zhǎng)reads和Hi-C技術(shù),實(shí)現(xiàn)了白粉虱基因組染色體級(jí)別的組裝。結(jié)果發(fā)現(xiàn)白粉虱基因組組裝大小為787Mb,含11條染色體級(jí)別scaffolds(scaffold" N50長(zhǎng)達(dá)70Mb);注釋到18,275個(gè)蛋白編碼基因,重復(fù)序列占基因組的56.6%;白粉虱發(fā)育階段特異性表達(dá)分析找到一些和白粉虱蛹化和羽化有關(guān)聯(lián)的基因,例如卵黃蛋白基因和cuticle基因;白粉虱和煙粉虱進(jìn)化上的分化程度遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于煙粉虱不同生物型之間;白粉虱和煙粉虱的比較基因組發(fā)現(xiàn),天冬氨酰蛋白酶家族在白粉虱中有顯著擴(kuò)張,這可能和白粉虱所特有的寄主偏好有關(guān);通過細(xì)胞色素P450家族的比較分析,在白粉虱找到和煙粉虱CYPCM1同源的4個(gè)P450基因,這4個(gè)基因有可能幫助到白粉虱代謝新煙堿類藥劑。(通訊員 曹檸)
原文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/1755-0998.13159