近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所農(nóng)業(yè)入侵生物預(yù)防與監(jiān)控創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)聯(lián)合國(guó)內(nèi)有關(guān)科研單位,首次完成南亞果實(shí)蠅染色體水平參考基因組組裝,并對(duì)其進(jìn)行了結(jié)構(gòu)和功能注釋。該研究填補(bǔ)了南亞果實(shí)蠅基因組數(shù)據(jù)的空白,對(duì)了解其遺傳學(xué)、生態(tài)學(xué)和進(jìn)化學(xué)具有重要意義,也為南亞果實(shí)蠅及其他近緣物種的科學(xué)防控提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在《科學(xué)數(shù)據(jù)(Scientific Data)》上。
南亞果實(shí)蠅是多食性農(nóng)業(yè)害蟲,危害多種經(jīng)濟(jì)作物,近年來(lái)其分布范圍不斷擴(kuò)張,對(duì)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成巨大危害。為得到高質(zhì)量基因組,研究人員首先構(gòu)建了南亞果實(shí)蠅的實(shí)驗(yàn)室種群,經(jīng)過(guò)9代近交降低雜合度后,采用單分子測(cè)序技術(shù)結(jié)合染色體構(gòu)象捕獲技術(shù),組裝得到421.79兆(Mb)基因組。共鑒定了20922個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,其中17251個(gè)基因同時(shí)被功能注釋。經(jīng)評(píng)估,基因組組裝完整度為99.7%,注釋完整度為97.6%。這一高質(zhì)量參考基因組將為進(jìn)一步研究南亞果實(shí)蠅的環(huán)境適應(yīng)性和入侵機(jī)制提供研究基礎(chǔ)。
該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等項(xiàng)目的支持。(通訊員:郭建英)
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