近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所(嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實(shí)驗(yàn)室深圳分中心)動(dòng)物功能基因組學(xué)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了迄今為止最全面的豬基因組結(jié)構(gòu)變異圖譜。相關(guān)研究成果發(fā)表在《基因組生物學(xué)(Genome Biology)》上。
豬是最重要的家畜之一。此前有研究表明豬的重要經(jīng)濟(jì)性狀(生長(zhǎng)、飼料效率和健康等)與結(jié)構(gòu)變異有關(guān),但由于受樣本量、品種、技術(shù)手段等因素的限制,無法對(duì)其相關(guān)性進(jìn)行精準(zhǔn)評(píng)估,阻礙了豬的品種改良進(jìn)展。
為此,研究人員收集了全球101個(gè)豬品種,共1060頭豬的基因組測(cè)序數(shù)據(jù),構(gòu)建了豬基因組的全面結(jié)構(gòu)變異圖譜,鑒定到數(shù)百萬個(gè)結(jié)構(gòu)變異事件。利用歐洲和亞洲豬品種之間的結(jié)構(gòu)變異重建了品種的祖先和雜交過程,解析了結(jié)構(gòu)變異對(duì)基因表達(dá)、功能元件和經(jīng)濟(jì)性狀的影響。該研究為豬的品種改良奠定了理論基礎(chǔ)。
該研究獲得國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的支持。(通訊員 馬昕怡)