由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所等8家單位聯(lián)合組成的科研團(tuán)隊(duì),在國(guó)際上率先完成了谷子單倍體型圖譜的構(gòu)建和47個(gè)主要農(nóng)藝性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析,相關(guān)成果于6月24日發(fā)表于《自然-遺傳學(xué)(Nature Genetics)》上,標(biāo)志著我國(guó)在谷子遺傳學(xué)研究領(lǐng)域取得了重要突破。
據(jù)項(xiàng)目負(fù)責(zé)人、作科所刁現(xiàn)民研究員介紹,谷子是起源于我國(guó)的古老作物,又稱為粟,脫殼后為小米,在我國(guó)北方有超過萬年的栽培史。谷子為二倍體,基因組小,自花授粉,具有突出的抗旱、耐瘠薄和高光效特性,是極具發(fā)展?jié)摿Φ暮瞪坦阮惸J阶魑?。我?guó)的谷子資源占世界存量的80%以上,但長(zhǎng)期以來,由于缺乏可靠、高效的分子標(biāo)記信息,科研人員對(duì)這些遺傳資源的群體結(jié)構(gòu)仍然缺乏了解,進(jìn)而限制了對(duì)谷子基因資源的高效發(fā)掘和深度利用。
該項(xiàng)目通過采用第二代高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)國(guó)內(nèi)外916份谷子品種開展了全基因組低倍重測(cè)序和序列分析,構(gòu)建出一張精細(xì)的谷子單倍體型圖譜;并對(duì)一份谷子品種和一份近緣野生種開展了深度基因組序列組裝,構(gòu)建了200萬個(gè)以上高密度分子標(biāo)志單倍型圖譜;采用全基因組關(guān)聯(lián)分析,在5個(gè)不同緯度環(huán)境下系統(tǒng)鑒定出了512個(gè)與株型、產(chǎn)量、花期、抗病性等47個(gè)農(nóng)藝性狀緊密相關(guān)的遺傳座位;還鑒定發(fā)掘了36個(gè)谷子新品種培育過程中受到選擇的特異基因位點(diǎn)。這些成果為谷子的遺傳改良及基因發(fā)掘研究提供了海量的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)信息,極大豐富了禾谷類作物比較遺傳學(xué)與功能基因組學(xué)的研究?jī)?nèi)容,將對(duì)未來禾谷類作物的品種改良、能源作物的遺傳解析產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響。
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