近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹(shù)研究所王力榮研究團(tuán)隊(duì)與深圳華大基因聯(lián)合開(kāi)展的桃全基因組重測(cè)序工作取得階段性進(jìn)展。該研究對(duì)84份桃種質(zhì)進(jìn)行重測(cè)序,在全基因組水平上繪制了從光核桃到普通桃的進(jìn)化路線(xiàn),并鑒定了與人工選擇相關(guān)的候選基因。相關(guān)研究結(jié)果在線(xiàn)發(fā)表于《基因組生物學(xué)》(Genome Biology)。
據(jù)項(xiàng)目主持人王力榮研究員介紹,普通桃起源于我國(guó)西藏的光核桃,然而在這2個(gè)種之間的其他近緣種的進(jìn)化關(guān)系一直以來(lái)存在爭(zhēng)議。通過(guò)此次重測(cè)序,可以確定普通桃的進(jìn)化始于光核桃,之后為山桃,再次為甘肅桃,最終形成普通桃,而新疆桃只能認(rèn)為是普通桃的一個(gè)地理類(lèi)群。
另外,與其他果樹(shù)相比,桃有個(gè)有趣的現(xiàn)象,即桃由于自交親和,一直被認(rèn)為是遺傳多樣性較低,然而桃上可以看到多種類(lèi)型,如有毛的毛桃、無(wú)毛的油桃、扁平的蟠桃和油蟠桃、重瓣的花型、不同的花藥顏色等,這些性狀的多樣性在其他果樹(shù)如李、杏、櫻桃、蘋(píng)果和葡萄上是看不到的。研究發(fā)現(xiàn),與野生的近緣種相比,雖然普通桃單核苷酸多態(tài)性(SNPs)只有野生桃的62.0%,然后在這些SNPs中,普通桃特有SNPs占到其總SNP的47.3%,該結(jié)果很好的解釋桃多樣性的矛盾現(xiàn)象。
桃重測(cè)序也發(fā)現(xiàn),由于桃自交親和及長(zhǎng)期采用嫁接繁殖,在馴化過(guò)程中桃的雜合率急速衰減,普通桃高的純合率不僅為解析其表型性狀的分子機(jī)制提供便利,也為桃作為薔薇科果樹(shù)分子生物學(xué)研究的模式樹(shù)種提供了有力的證據(jù)。(通訊員 吳斯洋)
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