近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所發(fā)布了兩個(gè)高質(zhì)量的檀香染色體水平基因組,揭示了檀香基因組的進(jìn)化歷史,為檀香新品種的開發(fā)、改良和保護(hù)奠定了基礎(chǔ)。相關(guān)研究成果發(fā)表在《通訊生物(Communications Biology)》上。
檀香被稱之為“黃金之樹”,以其持久和獨(dú)特的香氣而聞名,有很高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值,然而,除印度檀香外,檀香目其他品種均未報(bào)道過(guò)染色體級(jí)的基因組,為了更好地研究、利用和保護(hù)檀香屬的寶貴資源,研究團(tuán)隊(duì)利用HiFi測(cè)序和Hic組裝技術(shù),成功獲得了兩個(gè)檀香高質(zhì)量全基因組組裝序列,通過(guò)進(jìn)化基因組分析,描述了檀香基因組進(jìn)化歷史,發(fā)現(xiàn)檀香近期發(fā)生過(guò)一次全基因組復(fù)制事件,且為檀香科分支獨(dú)有,說(shuō)明了檀香科物種在與蒜頭果分化后發(fā)生了適應(yīng)性進(jìn)化。研究人員通過(guò)比較基因組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)檀香基因組中轉(zhuǎn)座子含量與檀香目另一物種蒜頭果基因組中轉(zhuǎn)座子含量相差巨大,導(dǎo)致前者的基因組的大小僅為后者的六分之一。
該研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院“青年英才計(jì)劃”等項(xiàng)目支持。(通訊員 馬昕怡)
原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s42003-023-04980-2
檀香基因組(左)和斐濟(jì)檀香基因組(右)