5月13日,記者從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院獲悉,該院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所農(nóng)業(yè)生物轉(zhuǎn)錄組與代謝組創(chuàng)新團隊發(fā)表了國際首個人參端粒到端粒完整基因組,并解析了人參重要活性成分三萜皂苷的形成機制。相關(guān)研究成果日前發(fā)表于國際期刊《園藝研究》。
人參被譽為“百草之王”,具有重要藥用價值。三萜皂苷是其主要活性成分之一,對中樞系統(tǒng)和心腦血管具有顯著保護作用。論文通訊作者、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員李偉告訴記者,人參屬于遺傳背景極其復(fù)雜的異源四倍體。研究團隊綜合應(yīng)用多種測序技術(shù),成功構(gòu)建了完整性高達99.3%的人參全基因組。此外,研究人員精確鑒定了48個端粒,并預(yù)測了24個著絲粒,顯著提高了人參基因組的連續(xù)性、完整性和精確度。
基于已構(gòu)建的高完整性人參基因組,研究人員對人參三萜皂苷合成基因在異源四倍體形成過程中的不平衡進化進行了深入探索。研究發(fā)現(xiàn),串聯(lián)重復(fù)和近端重復(fù)在人參三萜皂苷的生物合成過程中扮演了至關(guān)重要的角色。同時,在人參中有一個亞基因組的基因比另一個亞基因組的基因更為活躍,存在亞基因組優(yōu)勢現(xiàn)象。
“該研究為人參的遺傳研究、育種規(guī)劃,篩選優(yōu)質(zhì)人參種質(zhì)資源,以及探索三萜皂苷的生物合成路徑奠定了理論基礎(chǔ)。”李偉說。