由我國(guó)科學(xué)家領(lǐng)銜的白菜、甘藍(lán)和油菜全基因組測(cè)序項(xiàng)目日前又取得階段性重大成果,項(xiàng)目組完成了甘藍(lán)基因組測(cè)序和分析,并在此基礎(chǔ)上與其他近緣種植物基因組比較,發(fā)現(xiàn)了作物種間和種內(nèi)基因組呈現(xiàn)多層次的不對(duì)稱的進(jìn)化規(guī)律。該研究日前在線發(fā)表在國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《NatureCommunications》。
據(jù)甘藍(lán)項(xiàng)目組技術(shù)負(fù)責(zé)人、中國(guó)農(nóng)科院油料所研究員劉勝毅介紹,甘藍(lán)基因組與白菜基因組相似,其基因組的大部分能夠與十字花科近緣模式植物擬南芥基因組建立共線性關(guān)系,進(jìn)而為基因組進(jìn)化研究提供了良好的模式材料。通過對(duì)這組模式材料的分析,科學(xué)家最終揭示出甘藍(lán)和白菜基因組間存在轉(zhuǎn)座子擴(kuò)增的不對(duì)稱性、串聯(lián)重復(fù)基因擴(kuò)增的不對(duì)稱性、可變剪切數(shù)量的不對(duì)稱性及共線性區(qū)外基因丟失率的不對(duì)稱性,而在種內(nèi)的亞基因組間存在基因丟失率差異以及亞基因組間同源基因的序列分化、表達(dá)分化、可變剪切分化等不對(duì)稱性進(jìn)化。
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