近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所動(dòng)物功能基因組學(xué)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)研發(fā)出增強(qiáng)子鑒定新技術(shù)。該技術(shù)與傳統(tǒng)技術(shù)相比,平均分辨率提高了約10倍,為基因組的精確注釋提供了新方法。相關(guān)研究成果發(fā)表在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上。
增強(qiáng)子是一種基因組非編碼區(qū)的順式調(diào)控元件,它與啟動(dòng)子相互作用調(diào)控基因的表達(dá),對(duì)增強(qiáng)子的正確鑒定有助于理解基因表達(dá)機(jī)制。然而目前不同的技術(shù)對(duì)增強(qiáng)子鑒定的長度差別較大,導(dǎo)致基因組中這些增強(qiáng)子區(qū)域沒有被正確解讀。
為了解決這一問題,科研團(tuán)隊(duì)開發(fā)了增強(qiáng)子鑒定新技術(shù)。該技術(shù)的優(yōu)勢在于具有較高的準(zhǔn)確性和一致性,可以有效地去除序列冗余,直接鑒定序列的增強(qiáng)子功能。它還可以大規(guī)模地進(jìn)行增強(qiáng)子鑒定,適用于多種細(xì)胞類型。
該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程和廣東省自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的支持。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1093/nar/gkad1129