本報訊 3月16日,中國農(nóng)業(yè)科學院生物技術(shù)研究所微生物功能基因組創(chuàng)新團隊關(guān)于專性食線蟲真菌組學的研究成果,在線發(fā)表于《科學報告》(Scientifc Reports)(IF=5.58)。此項研究對于揭示食線蟲真菌和宿主間相互作用的分子機制以及綠色防控作物線蟲具有重要的理論和應用價值。
據(jù)了解,全世界每年由于植物寄生線蟲造成的農(nóng)業(yè)損失高達1570億美元。殺線蟲化學農(nóng)藥對環(huán)境造成巨大傷害,而利用真菌控制植物寄生線蟲低毒環(huán)保,是實現(xiàn)綠色防控的有效手段。真菌掘氏梅里菌(Drechmeriaconiospora)是一種專性食線蟲真菌,可以寄生并殺死多種農(nóng)作物病害線蟲,如番茄根結(jié)線蟲等,具有極強的宿主專一性和依賴性,在感染線蟲時還能合成具有殺線蟲活性的次級代謝產(chǎn)物梅里霉素,在作物寄生線蟲的綠色防控中具有廣泛的應用前景。
研究人員通過結(jié)合二代和三代測序技術(shù)以及轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),利用基因組測序和轉(zhuǎn)錄組分析,成功組裝了包括重復序列集中的著色粒和大部分端粒序列的全染色體序列,基因組完整度達到了國際頂尖水平。系統(tǒng)解析了掘氏梅里菌專性侵染秀麗隱桿線蟲的分子基礎(chǔ),篩選出一系列與殺線蟲相關(guān)的功能基因。研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),掘氏梅里菌基因組在進化過程中不斷簡化精煉,丟失了許多營腐生生活或昆蟲寄生相關(guān)的蛋白,保留甚至富集了降解宿主生物質(zhì)的水解酶、運轉(zhuǎn)宿主營養(yǎng)的轉(zhuǎn)運蛋白、與殺蟲相關(guān)的次級代謝產(chǎn)物、轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子等。在對掘氏梅里菌17個次級代謝產(chǎn)物合成基因簇的分析中,發(fā)現(xiàn)一個在感染秀麗隱桿線蟲時表達大小約為100kb的次級代謝產(chǎn)物合成基因簇。結(jié)合基因簇的生物信息學分析和梅里霉素結(jié)構(gòu)的串聯(lián)質(zhì)譜分析,確定了該基因簇為梅里霉素的合成基因簇并解析了梅里霉素的生物合成途徑。
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