[工人日?qǐng)?bào)]世界首個(gè)野生梨基因組圖譜完成
記者獲悉,中國(guó)農(nóng)科院果樹研究所研究員曹玉芬團(tuán)隊(duì)與中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所研究員田志喜團(tuán)隊(duì),日前合作組裝了高質(zhì)量的杜梨參考基因組序列——這是世界首個(gè)野生梨的基因組圖譜,也是我國(guó)在梨基因組學(xué)研究領(lǐng)域又一重大研究進(jìn)展。
該基因組的公布豐富了梨屬植物基因組信息,同時(shí)將為梨基因組研究、功能基因挖掘、梨屬植物馴化以及野生資源利用提供重要保障。
據(jù)曹玉芬團(tuán)隊(duì)介紹,科研人員以山西杜梨為材料,結(jié)合PacBio三代測(cè)序、Bionano光學(xué)圖譜、Hi-C技術(shù),組裝了高質(zhì)量的杜梨參考基因組序列。具體來(lái)看,杜梨基因組組裝大小為532.7兆,contig N50為1.57兆,共有59552個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因和247.4兆重復(fù)序列被注釋,通過(guò)BUSCO對(duì)基因組完整性進(jìn)行評(píng)估,完整性達(dá)到95.9%。
研究認(rèn)為,杜梨擴(kuò)張基因在次生代謝通路中顯著富集,可能進(jìn)而影響杜梨較強(qiáng)的逆境適應(yīng)性。分析結(jié)果顯示,馴化過(guò)程中,東方梨的果實(shí)大小、糖代謝和轉(zhuǎn)運(yùn),以及光合效率受到正向選擇。
研究同時(shí)發(fā)現(xiàn),梨屬植物在馴化過(guò)程中果實(shí)酸澀味逐漸消失。杜梨原花青素合成結(jié)構(gòu)基因拷貝數(shù)顯著多于白梨,影響了原花青素的積累,同時(shí)花青素還原酶代謝途徑是原花青素合成的唯一途徑,山梨醇轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)可能是影響可溶性有機(jī)物質(zhì)積累的主要因素。
- 習(xí)近平同越共中央總書記、國(guó)家主席蘇林會(huì)談2024-08-19
- 習(xí)近平同越共中央總書記、國(guó)家主席蘇林共同出席合作文件簽字儀式2024-08-19
- 習(xí)近平舉行儀式歡迎越共中央總書記、國(guó)家主席蘇林訪華2024-08-19
- 《二十大以來(lái)重要文獻(xiàn)選編》上冊(cè)出版發(fā)行2024-08-18
- 新型靶向功能鈍化材料強(qiáng)化鎘污染治理效果2024-08-16