本報訊(記者黃明明 通訊員 吳斯洋)近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所研究員王力榮團(tuán)隊與深圳華大基因聯(lián)合開展的桃全基因組重測序工作取得階段性進(jìn)展。該研究對84份桃種質(zhì)進(jìn)行重測序,在全基因組水平上繪制了從光核桃到普通桃的進(jìn)化路線,并鑒定了與人工選擇相關(guān)的候選基因。相關(guān)研究結(jié)果在線發(fā)表于《基因組生物學(xué)》。
普通桃起源于我國西藏的光核桃,然而在這2個種之間的其他近緣種的進(jìn)化關(guān)系一直以來存在爭議。通過此次重測序,可以確定普通桃的進(jìn)化始于光核桃,之后為山桃,再次為甘肅桃,最終形成普通桃,而新疆桃只能認(rèn)為是普通桃的一個地理類群。
其他果樹相比,桃一直被認(rèn)為是遺傳多樣性較低,然而仍可以看到多種類型,如有毛的毛桃、無毛的油桃、扁平的蟠桃和油蟠桃、重瓣的花型、不同的花藥顏色等,這些性狀的多樣性在其他果樹如李、杏、櫻桃、蘋果和葡萄上是看不到的。研究發(fā)現(xiàn),與野生的近緣種相比,雖然普通桃單核苷酸多態(tài)性(SNPs)只有野生桃的62.0%,然后在這些SNPs中,普通桃特有SNPs占到其總量的47.3%,該結(jié)果很好地解釋了桃多樣性的矛盾現(xiàn)象。
桃重測序也發(fā)現(xiàn),由于桃自交親和及長期采用嫁接繁殖,在馴化過程中桃的雜合率急速衰減,普通桃高的純合率不僅為解析其表型性狀的分子機(jī)制提供便利,也為桃作為薔薇科果樹分子生物學(xué)研究的模式樹種提供了有力的證據(jù)。